El Fondo Regional para los Pactos Territoriales sustituyó, según el artículo 250 del Plan Nacional de Desarrollo 2018-2022 "Pacto por Colombia, pacto la equidad", a El Fondo Regional para los Contratos Plan.

La operación del Fondo se orienta a facilitar la ejecución de los Pactos Territoriales y los Contratos Plan vigentes.

La ley del Plan precisó que se trata de un fondo de naturaleza especial. Una cuenta sin personería jurídica, adscrita al Departamento Nacional de Planeación. El Fondo empezó desde 2016 a ser administrada por Fonade, ahora ENTerritorio, entidad financiera del orden nacional, con participación estatal.

El Fondo está constituido con los recursos provenientes de las diferentes fuentes de financiación que en él concurran y sus recursos se destinan al cumplimiento de los acuerdos, objetivos, metas y resultados convenidos en cada Contrato Plan y/o Pacto Territorial.